La Oficina de Finanzas ejerce la dirección, supervisión y coordinación de las responsabilidades fiscales del Recinto distribuidas a través de una estructura compuesta por siete (8) áreas de  trabajo principales: Preintervención, Nóminas, Contabilidad, Finanzas, Pagador, Recaudaciones, Cobros y Reclamaciones y Fiscal de Asistencia Económica.

Esta oficina es la unidad del sistema universitario de mayor antigüedad. Su labor comienza en los años 1942 y 1949, cuando se reconoce a la Universidad de Puerto Rico como órgano de educación superior. Originalmente fue responsable de poner en función las disposiciones legales y establecer los controles de carácter fiscal en la institución.

Una vez el Recinto de Río Piedras obtiene su autonomía administrativa con la aprobación de la Ley Núm. 1 del 1966, se amplían sus facultades, responsabilidades y funciones fiscales. En el 1969, la Certificación Núm. 16 del Consejo de Educación Superior, le otorga la responsabilidad por la autorización de compromisos o desembolsos contra los fondos que le han sido asignados o que por medio de donaciones, legados o en cualquier otra forma que hayan sido aceptados y puestos a la disposición o bajo custodia del Recinto.

En el 1984 se aprueba el Reglamento General de Finanzas y Contabilidad. Este dispone que las oficinas de finanzas en las unidades institucionales sean las responsables de mantener el sistema y los procedimientos de contabilidad diseñados por la Oficina Central de Finanzas y de producir los informes requeridos para cumplir con sus obligaciones.

Hoy en día, la Oficina de Finanzas del Recinto es responsable también de la administración y fiscalización de los fondos externos que recibe de agencias federales, estatales, entidades privadas, interuniversitarios y extrauniversitarios. Además, atiende los asuntos relacionados con las pólizas de seguro, facilitando el manejo de las fianzas y las reclamaciones.

Finalmente, esta unidad realiza la función de Registro de Contratos para cumplir con los requisitos de la Oficina del Contralor.

La misión y visión del Departamento de Finanzas es definida por la Oficina de Finanzas:

Misión

Lograr el más eficiente control, uso y administración de los dineros y propiedades del Recinto, conforme a los principios y normas aplicables a las finanzas y contabilidad universitarias.

Visión

Ejercer la dirección y coordinación de labores en el Departamento de Finanzas asumiendo un rol facilitador y promotor de cambio mediante la sistematización y evaluación de los procesos y funciones y la puesta en vigor de las mejores prácticas de finanzas dirigidas a una oferta de servicios de excelencia.